Voor wie er de voorkeur aan geeft om eXamine binnen de eigen organisatie te draaien is er eXamine server. Dit is een webapplicatie die u zelf op een server kunt plaatsen.

Functioneel is eXamine server rijker dan eXamine.nl.

eXamine server is beschikbaar voor de meeste platforms, zoals Unix, Linux en Windows, in combinatie met de meest gangbare web-servers en database servers.

Ook is het mogelijk een volledig ingerichte machine inclusief de eXamine server software aan te schaffen, de eXamine appliance server.

De standaard configuratie bestaat uit een Linux server met de volgende systeemspecificaties: 1 AMD Athlon XP of Pentium 4 processor, 256 MB RAM, 2 HDD van 40 GB elk, in een 19'' PC rack.
De hierop geïnstalleerde variant van eXamine maakt gebruik van de Apache web-server en de MySQL database.
Op aanvraag zijn ook andere configuraties leverbaar.